职能科室:院办公室、党群工作办公室(党委办公室、工会委员会、妇委会、计生办、纪检监察室、团委)、人力资源部、财务部、医务部、护理部、科研科、质控部、设备科、物价与医疗保险管理科、保卫科、教学科、总务科、感染管理科、预防保健科、信息技术部、事业发展部,信访办、内审室、退管办、医疗风险防范办公室、三甲办公室、统计室、三名工程办公室、图书馆、住院医师规培办公室、专科医师规培办公室医院改革综合研究室。

临床科室:介入放射科、神经外科、胃肠外科、心脏大血管外科整形美容外科、胸外科、甲状腺乳腺外科、手显微血管外科、脊柱外科、骨关节科、泌尿外科、肝胆胰外科、外科内镜室、肛肠外科、中医科、康复医学科、全科医学科、肿瘤科(肿瘤内科、肿瘤放疗科)、疼痛科、耳鼻咽喉科、口腔医学中心(口腔颌面外科、口腔内科、口腔修复科、口腔正畸科、口腔种植科、口腔放射室、一门诊口腔科)、麻醉科、皮肤科、手术室、老年病科、妇科、产科、计划生育科、重症医学科、儿科(儿内科、新生儿科)、感染病科、宁养院、眼科、高压氧科、风湿免疫科、肾内科(血液净化室)、消化内科、内分泌科、血液内科、神经内科、呼吸与危重症医学科(原呼吸内科)、心血管内科。

医技:超声科、核医学科、病理科、法医物证室、生物治疗室、放射科(普通放射科、CT/MRI室)、病案管理科、输血科、营养科、药学部(制剂室、药品质检室室、中药室、药品调剂室、临床药学研究室)、检验科(急诊检验室、一门诊检验室、二门诊检验室、临床化学检验室、血液学检验室、免疫学检验室、微生物学检验室、分子生物学检验室)、消毒供应中心。

门急诊、体检:一门诊、特诊科、二门诊、网络医院、体检科、急诊科(急诊内科、急诊外科、急诊病房)。

研究机构国家临床药物试验机构办公室、临床医学研究中心、转化医学协同创新中心、呼吸疾病研究所、骨科研究所、肿瘤研究所、消化研究所、生物医学工程研究院。

龙华分院