深圳市呼吸疾病医学重点实验室
深圳市呼吸疾病医学重点实验室成立于2015年，该重点实验室的战略定位是瞄准中长期科技发展规划，以常见重大呼吸系统疾病为切入点，研究呼吸疾病的发生、发展规律，探索临床诊治规范。其拥有活跃的学术思想、完善的自主创新体系和广泛的学术交流平台。
深圳市干细胞与细胞治疗重点实验室
2011年12月，深圳市卫生与计划生育委员会正式批准依托于深圳市人民医院建设深圳市干细胞与细胞治疗实验室.2015年12月深圳市发展与改革委员会批准依托深圳市人民医院筹建深圳市细胞治疗公共服务平台。医院投入1720万元，装修实验室3000平方米，购置各类专用设备91台。主要以干细胞治疗糖尿病，肿瘤免疫细胞治疗为主要研究方向。先后承担国家863项目1项，国家973前期专项2项，国家自然科学基金3项，广东省和深圳市重大项目18项，获资助1000余元万元。发表SCI论文30余篇，CSCD论文200余篇，获国家发明专利授权3项。先后获得广东省科学技术进步二等奖1项，教育部科学技术进步二等奖1项，深圳市科学技术进步一等奖1项，深圳市科技创新奖2项，深圳市科学技术进步三等奖二项。
深圳市病原微生物及细菌耐药监控重点实验室
2012年7月，深圳市科技创新委员会正式批准病原微生物及细菌耐药监控重点实验室依托于深圳市人民医院建设，病原微生物及细菌耐药监控重点实验室正式成立。课题组针对目前细菌耐药的严峻形势，开展相关细菌耐药的基础理论与应用研究。着眼深圳本土细菌耐药的监测及早期预警，研究多药耐药致病菌感染的流行病学特点及危险因素。致力构建深圳市耐药菌群监测网，定期向卫生行政主管部门提供微生物感染现状及耐药数据，为感染控制提供科学依据。
深圳市肾脏疾病重点实验室
2014年9月，在深圳市政府主持的“三名工程”项目推动下，正式批准深圳市肾脏疾病重点实验室依托于中国人民解放军总医院（301医院）解放军肾脏病研究所建设，深圳市肾脏疾病重点实验室正式成立。依托单位解放军总医院肾脏病专科医院具备建立国家临床医学研究中心的坚实基础和独特优势：是本领域唯一的集国家重点学科与国家重点实验室为一体的领先学科，解放军总医院是规模最大、实力最雄厚的研究型医院，是国家重要的保健基地，拥有健全的网络信息化系统，能够提供临床中心建设所需的一切保障。
诺贝尔奖科学家实验室
深圳市诺贝尔奖科学家实验室成立于2019年，该实验室的战略定位是瞄准中长期科技发展规划，着眼于衰老和重大慢性病的基础研究与新型治疗干预手段开发。。。
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