检验科新开展项目——丙型肝炎基因精准分型
一、测序是检测丙型肝炎病毒HCV基因型最准确的方法
HCV基因易发生变异,基因组序列呈高度异质性。目前已发现的HCV为7种型别以及几十种亚型。临床上用于治疗丙肝的直接抗病毒药物(DAAs)多是针对感染某种特异基因型的患者,因此用药前需对患者检测HCV基因型别。
Sanger测序法是检测HCV基因型最准确的方法。Sanger-测序法首先通过具有相对保守区域的引物扩增出HCV的目标片段,然后进行测序获得目标片段的序列信息,最后与数据库中已知基因型的序列进行比对,找到与目标序列最为接近的型别,所以无论待测样本是哪种型别,都可以进行精准分型。而PCR法则是带有不同荧光集团的探针与目标片段非特异性结合,易出现分型错误或分不出。
二、丙肝精准分型检测的临床意义
多部指南(《EASL丙型肝炎指南》(2018 版)、《感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南》(2017版)等)推荐治疗前须检测HCV基因型,以确定治疗方案、治疗疗程及其他相关参数。
1、可以帮助临床医生为患者选择最佳的用药方案,节省患者药物费用支出同时获得最优治疗效果。
2、准确的基因分型,可有效帮助医生分析临床症状,预测病情转归以及药物治疗效果。
3、精准分型可以帮助临床医生对较难治疗的型别(如3型)提前进行预判,重点关注,提高疗效。
HCV型别多种多样,精准分型有助于新型别的发现,了解其进化途径,分布特征。
三、检测位点对分型的意义
? 扩增亚型间差异大C/E1区的680bp
? 扩增效率高
? 可区别中国常见的6种HCV型别及几十种亚型。
四、出报告时间
每周检测一次,合格标本第二检测周期前出结果)。可疑结果需要复查顺延到下一个检测日。仪器故障等原因出报告时间另行通知。
咨询电话:检验科分子生物学实验室电话:2686
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